يعتمد نموذج عمل الصندوق العربي لحقوق الإنسان على خبرة العديد من مؤسسات العطاء الإنساني الدولية، ويتلخص بوضع ميزانية للمنح تتغذى بشكل رئيسي من عوائد رأس المال المستثمر كوديعة دائمة. يسعى الصندوق إلى جمع وديعة تغطي برامح المنح والتكاليف الإدارية ورواتب الموظفين.

بناءً على ذلك، فإن جمع التبرعات هو من أهم الأولويات لضمان استدامة الصندوق ومقدرته على توفير المزيد من الموارد لدعم حقوق الإنسان في المنطقة.

وتهدف هذه المقاربة التي تقضي بتحويل التبرعات إلى وديعة دائمة بدلاً من صرفها مباشرة كمنح، إلى ضمان استدامة المشروع على المدى الطويل، وضمان استقلالية صنع قرار الصندوق فيما يتعلق بالمنح.